O Eco-Museu da Ilha da Pólvora é um museu brasileiro localizado na cidade de Rio Grande, no estado do Rio Grande do Sul. Foi inaugurado no dia 22 de abril de 1999 e abre à visitação de sextas-feiras a domingos, das 14 às 18 horas, O translado até a ilha é realizado por embarcação, com saída do píer do Museu Oceanográfico
O museu conta com o apoio do Exército Brasileiro que, juntamente com a Fundação Universidade do Rio Grande, viabilizaram a sua criação.
Está localizado na Ilha da Pólvora, uma das ilhas do estuário da Laguna dos Patos. Possui 42 hectares de marismas (áreas periodicamente alagadas pela maré) que servem de habitat para várias espécies de aves, roedores, larvas e juvenis de peixes, moluscos e crustáceos.
No Eco-Museu são desenvolvidos diversos trabalhos científicos de graduação e pós-graduação, destacando-se os estudos sobre a vegetação, os crustáceos, as aves e os roedores.
